Biokemijska sposobnost otpadnih voda odnosi se na to u kojoj mjeri onečišćujuće tvari sadržane u otpadnoj vodi mogu promijeniti kemijsku strukturu onečišćujućih tvari kroz životnu aktivnost mikroorganizama, čime se mijenjaju kemijska i fizikalna svojstva onečišćujućih tvari.
Naime, biološka obrada ne zahtijeva potpunu razgradnju organske tvari na CO2, H2O i nitrate itd., već samo uklanjanje onečišćujućih tvari u vodi u mjeri u kojoj to okoliš dopušta.
1, Alifatski ugljikovodici ili n-alkani lakše se razgrađuju od aromatskih ugljikovodika ili cikloalkana; nezasićeni alifatski spojevi lakše se razgrađuju.
2, Razgradnja ravnolančanih ugljikovodika srednjeg i dugog lanca lakša je od razgradnje ugljikovodika kratkog lanca.
3, Razgradnja ugljikovih spojeva iznad propana u alkanima je lakša kako se povećava broj ugljikovih atoma.
4, Netopljive tvari, poput mineralnog ulja, otporne su na degradaciju.
5, Molekularna veličina spojeva povezana je s razgradivošću. Polimeri i kompleksi imaju veću otpornost na razgradnju, a enzimske molekule se ne mogu približiti i uništiti njihovu unutarnju strukturu.
6, Izomerni učinak organskih spojeva utječe na razgradljivost. Priroda, broj i položaj zamjenskih skupina sadržanih u spojevima utječu na razgradljivost.
7, Kada u glavnom lancu spoja postoje elementi bez ugljika, razgradnja je vrlo teška.
8, Fenoli se lako razgrađuju, ketoni su između aldehida i alkohola, ali butenoni se teško razgrađuju. Većina organskih tvari predstavljenih fenolima može se razgraditi pri niskim koncentracijama, ali pri visokim koncentracijama toksičnost će inhibirati životnu aktivnost mikroorganizama.
9. Ako se zagađivači u otpadnoj vodi miješaju, fenomen polimerizacije i spajanja će povećati njihovu sposobnost protiv razgradnje. Miješanje otrovnih tvari također će povećati toksični učinak.
10, Izvorne tvari u prirodi lakše se razgrađuju, dok je sintetičke teže.